مقایسه میزان استفاده از کدون های مترادف بین قسمت های کد شونده ژنوم ویروس های پاپیلوما انسانی کم خطر و پر خطر با استفاده از روش بیوانفورماتیکی

ویروس های پاپیلوما انسانی، ویروس های کوچک و بدون پوششی هستند که ژنوم آن ها dna دو رشته ای حلقوی است. ژنوم این ویروس ها تعدادی پروتئین اولیه و تعدادی پروتئین تأخیری را کد می کند. این ویروس ها بر اساس ایجاد ضایعات بدخیم و سرطان ها به دو گروه کم خطر و پر خطر دسته بندی می شوند. هدف از این پژوهش بررسی میزان استفاده از کدون های مترادف بین قسمت های کد شونده ژنوم انواع کم خطر و پر خطر ویروس پاپیلومای انسانی است. به همین منظور میزان استفاده از کدون های مترادف بین قسمت های کد شونده ژنوم انواع کم خطر و پر خطر ویروس پاپیلوما انسانی از وب گاه cutg (http://www.kazusa.or.jp/codon) جمع آوری و با استفاده از نرم افزاری آماری roc، میزان استفاده از هریک از کدون های مترادف قسمت های کد شونده ژنوم ویروس های پاپیلوما انسانی در انواع کم خطر و پر خطر مقایسه شد. آنالیز آماری داده ها نشان داد که 5 کدون uau (تیروزین)، ugu (سیستئین)، aca (ترئونین)، agg (آرژنین) و guc (والین) به طور معنا داری در انواع کم خطر و پر خطر متفاوت هستند. بررسی الگوی استفاده از کدون ها، می تواند در طبقه بندی ویروس های پاپیلومای انسانی کم خطر و پر خطر روشی موثر باشد.